Diagnóstico viral e limpeza clonal de matrizes de maracujazeiro (Passiflora edulis Sims) utilizadas na produção de sementes híbridas

dc.contributor.advisor1Pereira, Jonny Everson Scherwinski
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/7270239356755951por
dc.contributor.advisor1orcidhttps://orcid.org/0000-0001-6271-332Xpor
dc.contributor.referee1Atroch, Eva Maria Alves Cavalcanti
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/6901991395547602por
dc.contributor.referee2Faleiro, Fábio Gelape
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/9679761162805267por
dc.contributor.referee2orcidhttps://orcid.org/0000-0001-8901-6428por
dc.creatorRibeiro, Elias da Cruz
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/6575674221708277por
dc.date.issued2021-02-05
dc.description.abstractThis work aimed to perform the viral diagnosis and cloanl cleaning of passion fruit (Passiflora edulis Sims) matrices used for hybrid seed production. To carry out the viral diagnosis, leaves of the genotypes CPMSC1, CPGA1, MR1, CPMGA2 and CPF1SSBR were collected and the RNA and DNA extracted and used for viral detection by RT-PCR and PCR, using primers that encode Cowpea aphid-brone mosaic virus (CABMV), Lettuce chlorosis virus (LCV) and Begomovirus genomic regions. In addition, the results obtained by using CABMV primers were hybridized by Southern blot for a more reliable diagnosis. The results revealed the presence of CABMV in 100% of the samples tested for all matrices. Furthermore, CPGA1 (17%) and CPMSC (11%) samples tested positive using the universal primers for begomoviruses. No sample tested positive for LCV. In a second experiment, a micropropagation protocol for the genotypes was developed, in order to perform a matrices multiplication arising from the clonal cleaning. Therefore, initially the best explant was evaluated for the in vitro establishment and multiplication phase. It was found that the development of pre-existing buds is only observed in the single node cuttings, compared to inoculation of isolated buds, generating shoots with an average size of 7 mm after 45 days of cultivation. Then, Only single node cuttings were used in another in vitro establishment experiment using MS medium supplemented with 4.43 µM of BA. In it, the shoots development was observed with at least 6 mm after 30 days of culture. The material arising from the single nodes cuttings was used for the other multiplication, elongation and rooting experiments. Finally, to test the efficiency of shoot tip culture in CABMV eliminating in previously diagnosed matrices, apical meristems (0.1 - 0.3 mm) were isolated and inoculated in MS medium supplemented with 0.44 µM NAA, 0.44 µM BA and 0.28 µM GA3. After the apical meristema regeneration, the explants were transferred to MS medium with 4.43 µM BA to induce shoot proliferation and multiplication. Shoot clusters from the shoot tip culture were used to index the plant material for the presence of CABMV by means of RT-PCR. The observed results showed a decrease in the bands intensity referring to CABMV in the genotypes CPGA1, MR1 and CPMGA2, an indication of decreased viral load. Finally, viral cleaning was observed in only one sample of the CPGA1 genotype.eng
dc.description.resumoEste trabalho teve por objetivo realizar o diagnóstico viral e a limpeza clonal de matrizes de maracujazeiro (Passiflora edulis Sims) utilizadas na produção de sementes híbridas. Para a realização do diagnóstico viral, folhas dos genótipos CPMSC1, CPGA1, MR1, CPMGA2 e CPF1SSBR foram coletadas e o RNA e DNA extraídos para a detecção viral por RT-PCR e PCR, utilizando primers que codificam regiões genômicas de Cowpea aphid-borne mosaic virus (CABMV), Lettuce chlorosis virus (LCV) e Begomovirus. Complementarmente, os resultados obtidos para os primers de CABMV foram hibridizados por Southern blot para um diagnóstico mais confiável. Os resultados revelaram a presença de CABMV em 100% das amostras de todas as matrizes testadas. Além disso, amostras de CPGA1 (17%) e de CPMSC (11%) foram positivas utilizando os primers universais de begomovírus. Nenhuma amostra foi positiva para LCV. Num segundo experimento, um protocolo para a micropropagação dos genótipos foi desenvolvido, visando a posterior multiplicação das matrizes oriundas da limpeza clonal. Para tanto, inicialmente foi avaliado o melhor explante para a fase de o estabelecimento e multiplicação in vitro. Verificou-se que o desenvolvimento de gemas preexistentes foi observado apenas nas microestacas, em relação à inoculação de gemas isoladas, gerando brotos com tamanho médio de 7 mm após 45 dias de cultivo. Em seguida, apenas as microestacas foram utilizadas em novo experimento para o estabelecimento in vitro em meio de MS acrescido de 4,43 μM de BAP. Nele, observou-se o desenvolvimento de brotos com pelo menos 6 mm após 30 dias de cultivo. O material proveniente destas microestacas foi utilizado para os demais experimentos de multiplicação, alongamento e enraizamento. Por fim, para testar a eficiência da cultura de ápices caulinares na eliminação do CABMV nas matrizes previamente diagnosticadas, ápices caulinares (0,1 - 0,3 mm) foram isolados e inoculados em meio de MS acrescido de 0,05 μM de ANA, 0,44 μM de BAP e 0,28 μM de AG3. Após a regeneração do meristema apical, os explantes foram transferidos para meio de MS acrescido de 4,43 μM de BAP para indução de proliferação de gemas e multiplicação. Agregados de gemas provenientes da cultura de ápices caulinares foram utilizados para indexação do material vegetal para o vírus CABMV por meio de RT-PCR. Os resultados observados demonstraram diminuição na intensidade das bandas referentes ao CABMV nos genótipos CPGA1, MR1 e CPMGA2, indicando diminuição de carga viral. Por fim, a limpeza viral foi observada em apenas uma amostra do genótipo CPGA1.por
dc.description.sponsorshipFAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonaspor
dc.description.sugestaoNão encontrei nenhuma dificuldade significativa. O site é intuitivo e explicativo.por
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationRIBEIRO, Elias da Cruz. Diagnóstico viral e limpeza clonal de matrizes de maracujazeiro (Passiflora edulis Sims) utilizadas na produção de sementes híbridas. 2021. 89 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2021.por
dc.identifier.urihttps://tede.ufam.edu.br/handle/tede/8170
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal do Amazonaspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicaspor
dc.publisher.initialsUFAMpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologiapor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.subjectDiagnóstico viralpor
dc.subjectÁpices caulinarespor
dc.subjectMicroestacaspor
dc.subjectMaterial vegetalpor
dc.subjectMeristema apicalpor
dc.subject.cnpqCIÊNCIAS BIOLÓGICASpor
dc.subject.userPassiflora edulispor
dc.subject.userCultura de ápices caulinarespor
dc.subject.userMicropropagaçãopor
dc.subject.userCABMVpor
dc.thumbnail.urlhttps://tede.ufam.edu.br//retrieve/44548/Disserta%c3%a7%c3%a3o_EliasRibeiro_PPGBIOTEC.pdf.jpg*
dc.titleDiagnóstico viral e limpeza clonal de matrizes de maracujazeiro (Passiflora edulis Sims) utilizadas na produção de sementes híbridaspor
dc.title.alternativeViral diagnosis and clonal cleaning of passion fruit matrices (Passiflora edulis Sims) used in hybrid seed productioneng
dc.typeDissertaçãopor

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