Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos

dc.contributor.advisor1Andrade, Edmar Vaz de
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/4691893433367918por
dc.contributor.referee1Brigido, Marcelo de Macedo
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/2482060270236527por
dc.contributor.referee2Neiva, Márcia
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/4524897490719405por
dc.contributor.referee3Nascimento, Alessandra Karisa Costa Lima do
dc.contributor.referee3Latteshttp://lattes.cnpq.br/1351738158354765por
dc.contributor.referee4Willerding, André Luis
dc.contributor.referee4Latteshttp://lattes.cnpq.br/4510611262827047por
dc.creatorSouza Neto, Júlio Nino de
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/1147767409158974por
dc.date.issued2019-07-19
dc.description.abstractAccidental spills of crude oil can have catastrophic consequences in natural environments. However, some native bacterial populations can thrive under these conditions by utilizing crude oil components in their metabolism. This natural ability of bacteria can be used to gather genetic and metabolic information to contribute to the development of new bioremediation technologies, such as cleaning industrial waste. Thus, this research investigated the biodegradation potential of Acinetobacter junii SB132, by experimental procedures and genomic analyzes, to understand its mechanisms of interaction, absorption and metabolization of hydrophobic compounds of diesel oil. This bacterial strain, previously isolated by selection on petroleum-containing substrate and identified by morphological and molecular analysis, had the ability to grow in diesel oil as sole carbon and energy source. In addition, in laboratory tests, emulsion layers were observed between cell free culture supernatant and hydrophobic compounds. Additionally, fresh oil-free cells were able to adhere to hydrophobic substrates as well as form a biofilm on the polystyrene plate surface. Its genome draft had a size of 3.5 Mb, which is equivalent to the genomes of the Acinetobacter strains deposited in GenBank, in which the annotation revealed subsystems related to the metabolism of aliphatic and aromatic hydrocarbons. Thus, it is possible that A. junii SB132 uses cell adhesion mechanisms, through biofilm formation, to contact the hydrophobic substrates present in diesel oil and so be able to metabolize them through the degradation pathways of these compounds.eng
dc.description.resumoDerrames acidentais de petróleo podem ter consequências catastróficas em ambientes naturais. No entanto, algumas populações nativas de bactérias podem prosperar nestas condições, utilizando componentes do petróleo bruto em seu metabolismo. Esta capacidade natural das bactérias pode ser usada na obtenção de informações genéticas e metabólicas para contribuir com o desenvolvimento de novas tecnologias de biorremediação, como, por exemplo, na limpeza de resíduos industriais. Assim, nesta pesquisa foi investigado o potencial de biodegradação da Acinetobacter junii SB132, por procedimentos experimentais e análises genômicas, para entender seus mecanismos de interação, absorção e metabolização de compostos hidrofóbicos do óleo diesel. Esta cepa bacteriana, previamente isolada por seleção em substrato contendo petróleo e identificada por análises morfológicas e moleculares, teve a capacidade de crescer em óleo diesel como sua única fonte de carbono e energia. Além disso, em testes laboratoriais foram observadas camadas de emulsão entre o sobrenadante de cultura, livre de células, e compostos hidrofóbicos. Adicionalmente, células frescas, livres de óleo, foram capazes de aderir aos substratos hidrofóbicos, bem como formar biofilme sobre a superfície de placa de poliestireno. O rascunho do genoma desta bactéria teve um tamanho de 3,5 Mb, tamanho este equivalente aos genomas das cepas deste gênero depositados no GenBank, e sua anotação revelou subsistemas relacionados ao metabolismo de hidrocarbonetos alifáticos e aromáticos. Assim, é possível que a A. junii SB132 utilize mecanismos de adesão celular, via formação de biofilme, para entrar em contato com os substratos hidrofóbicos presentes no óleo diesel e, assim, poder metabolizá-los pelas vias de degradação destes compostos.por
dc.description.sponsorshipCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorpor
dc.description.sponsorshipCNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológicopor
dc.description.sponsorshipFAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonaspor
dc.description.sugestaoNos campos "áreas de conhecimento de acordo com o CNPq", poderia ter um link que direcionasse para esta lista de áreas.por
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationSOUZA NETO, Júlio Nino. Caracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicos. 2019. 153 f. Tese (Doutorado em Biotecnologia) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019.por
dc.identifier.urihttps://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7321
dc.languageporpor
dc.publisherUniversidade Federal do Amazonaspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentInstituto de Ciências Biológicaspor
dc.publisher.initialsUFAMpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-Graduação em Biotecnologiapor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.rights.urihttp://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/
dc.subjectGenômicapor
dc.subjectBactériaspor
dc.subjectBiodegradaçãopor
dc.subject.cnpqCIÊNCIAS BIOLÓGICAS: GENÉTICA: GENÉTICA MOLECULAR E DE MICROORGANISMOSpor
dc.subject.userGenomapor
dc.subject.userBioinformáticapor
dc.subject.userPoluentepor
dc.subject.userBiofilmepor
dc.thumbnail.urlhttps://tede.ufam.edu.br//retrieve/32926/Tese_J%c3%balioSouzaNeto_PPGBIOTEC.pdf.jpg*
dc.titleCaracterização genômica de Acinetobacter junii SB132 degradadora de diesel e sua interação com substratos hidrofóbicospor
dc.title.alternativeGenomic characterization of diesel degrading Acinetobacter junii SB132 and its interaction with hydrophobic substrateseng
dc.typeTesepor

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