Network science approach for enrichment analysis in breast and ovarian cancer

dc.contributor.advisor-co1Nakamura, Fabíola Guerra
dc.contributor.advisor-co1Latteshttp://lattes.cnpq.br/9615041048900531por
dc.contributor.advisor-co1orcidfabiola@icomp.ufam.edu.brpor
dc.contributor.advisor1Nakamura, Eduardo Freire
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/1448696292042915por
dc.contributor.referee1Silva, Altigran Soares da
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/3405503472010994por
dc.contributor.referee2Silva, Cláudio
dc.contributor.referee3Fenyo, David
dc.creatorOkimoto, Leandro Youiti Silva
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3079897846370401por
dc.date.issued2019-06-04
dc.description.abstractThe imprecise identification of cancer characteristics can lead the patient to aggressive and unnecessary treatments. Therefore, it is crucial to identify tumor intrinsic characteristics more precisely to propose individual-tailored treatment. In this work, we present a brief explanation of fundamentals and researches in computer graph theory that seek to solve problems of identification, classification, and characterization of certain cancer types. We proposed a novel solution based on Network Science to find a list of genes for enrichment analysis in Breast and Ovarian cancer using proteogenomic information. In our results, we show that our approach is capable of capturing biological processes and sets of genes related to cancer and other processes, which opens a range of possibilities for further studies.eng
dc.description.resumoA identificação imprecisa das características do câncer pode levar o paciente a tratamentos agressivos e desnecessários. Portanto, é crucial identificar as características intrínsecas do tumor de forma mais precisa para propor tratamentos individualizados. Neste trabalho, apresentamos uma breve explicação dos fundamentos e pesquisas em teoria de grafos computacionais que buscam resolver problemas de identificação, classificação e caracterização de certos tipos de câncer. Nós propusemos uma nova abordagem baseada em Análise de Redes para encontrar listas de genes que servirão de entrada para análise de enriquecimento em câncer de mama e ovário usando informação proteogenômica. Em nossos resultados, mostramos que nossa abordagem é capaz de capturar processos biológicos e conjuntos de genes relacionados ao câncer e a outros processos, o que abre uma série de possibilidades para novos estudos.por
dc.description.sponsorshipCAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superiorpor
dc.formatapplication/pdf*
dc.identifier.citationOKIMOTO, Leandro Youiti Silva. Network science approach for enrichment analysis in breast and ovarian cancer. 2019. 62 f. Dissertação (Mestrado em Informática) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019.por
dc.identifier.urihttps://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7231
dc.languageengpor
dc.publisherUniversidade Federal do Amazonaspor
dc.publisher.countryBrasilpor
dc.publisher.departmentInstituto de Computaçãopor
dc.publisher.initialsUFAMpor
dc.publisher.programPrograma de Pós-graduação em Informáticapor
dc.rightsAcesso Abertopor
dc.subjectMamas - Câncerpor
dc.subjectOvários - Câncerpor
dc.subjectTeoria dos grafospor
dc.subject.cnpqCIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: CIÊNCIA DA COMPUTAÇÃOpor
dc.thumbnail.urlhttps://tede.ufam.edu.br//retrieve/31797/Disserta%c3%a7%c3%a3o_LeandroOkimoto_PPGI.pdf.jpg*
dc.titleNetwork science approach for enrichment analysis in breast and ovarian cancerpor
dc.typeDissertaçãopor

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