Network science approach for enrichment analysis in breast and ovarian cancer
| dc.contributor.advisor-co1 | Nakamura, Fabíola Guerra | |
| dc.contributor.advisor-co1Lattes | http://lattes.cnpq.br/9615041048900531 | por |
| dc.contributor.advisor-co1orcid | fabiola@icomp.ufam.edu.br | por |
| dc.contributor.advisor1 | Nakamura, Eduardo Freire | |
| dc.contributor.advisor1Lattes | http://lattes.cnpq.br/1448696292042915 | por |
| dc.contributor.referee1 | Silva, Altigran Soares da | |
| dc.contributor.referee1Lattes | http://lattes.cnpq.br/3405503472010994 | por |
| dc.contributor.referee2 | Silva, Cláudio | |
| dc.contributor.referee3 | Fenyo, David | |
| dc.creator | Okimoto, Leandro Youiti Silva | |
| dc.creator.Lattes | http://lattes.cnpq.br/3079897846370401 | por |
| dc.date.issued | 2019-06-04 | |
| dc.description.abstract | The imprecise identification of cancer characteristics can lead the patient to aggressive and unnecessary treatments. Therefore, it is crucial to identify tumor intrinsic characteristics more precisely to propose individual-tailored treatment. In this work, we present a brief explanation of fundamentals and researches in computer graph theory that seek to solve problems of identification, classification, and characterization of certain cancer types. We proposed a novel solution based on Network Science to find a list of genes for enrichment analysis in Breast and Ovarian cancer using proteogenomic information. In our results, we show that our approach is capable of capturing biological processes and sets of genes related to cancer and other processes, which opens a range of possibilities for further studies. | eng |
| dc.description.resumo | A identificação imprecisa das características do câncer pode levar o paciente a tratamentos agressivos e desnecessários. Portanto, é crucial identificar as características intrínsecas do tumor de forma mais precisa para propor tratamentos individualizados. Neste trabalho, apresentamos uma breve explicação dos fundamentos e pesquisas em teoria de grafos computacionais que buscam resolver problemas de identificação, classificação e caracterização de certos tipos de câncer. Nós propusemos uma nova abordagem baseada em Análise de Redes para encontrar listas de genes que servirão de entrada para análise de enriquecimento em câncer de mama e ovário usando informação proteogenômica. Em nossos resultados, mostramos que nossa abordagem é capaz de capturar processos biológicos e conjuntos de genes relacionados ao câncer e a outros processos, o que abre uma série de possibilidades para novos estudos. | por |
| dc.description.sponsorship | CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior | por |
| dc.format | application/pdf | * |
| dc.identifier.citation | OKIMOTO, Leandro Youiti Silva. Network science approach for enrichment analysis in breast and ovarian cancer. 2019. 62 f. Dissertação (Mestrado em Informática) - Universidade Federal do Amazonas, Manaus, 2019. | por |
| dc.identifier.uri | https://tede.ufam.edu.br/handle/tede/7231 | |
| dc.language | eng | por |
| dc.publisher | Universidade Federal do Amazonas | por |
| dc.publisher.country | Brasil | por |
| dc.publisher.department | Instituto de Computação | por |
| dc.publisher.initials | UFAM | por |
| dc.publisher.program | Programa de Pós-graduação em Informática | por |
| dc.rights | Acesso Aberto | por |
| dc.subject | Mamas - Câncer | por |
| dc.subject | Ovários - Câncer | por |
| dc.subject | Teoria dos grafos | por |
| dc.subject.cnpq | CIÊNCIAS EXATAS E DA TERRA: CIÊNCIA DA COMPUTAÇÃO | por |
| dc.thumbnail.url | https://tede.ufam.edu.br//retrieve/31797/Disserta%c3%a7%c3%a3o_LeandroOkimoto_PPGI.pdf.jpg | * |
| dc.title | Network science approach for enrichment analysis in breast and ovarian cancer | por |
| dc.type | Dissertação | por |
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